1、民國38年，成立白河鎮衛生所，隸屬臺南縣衛生院，設址於白河鎮開明街14號。
2、民國39年9月，開始辦理門診業務。在首位所長劉守成先生熱心策劃與地方父老之鼎力相助支持，使本鎮衛生行政日漸茁壯並得上級重視。
3、民國49年，改隸屬本鎮鎮公所，並於白河鎮國光路5號興建48坪一樓辦公廳，推行門診及一般行政工作。
4、民國63年，因全盤業務與指揮監督需要，奉行政院令准予改隸屬臺南縣衛生局。
5、民國69年，因原有空間不敷使用，於原址改建現有之96坪二樓辦公廳。
6、民國70年，由臺灣省政府衛生處專款補助，於崎內里興建衛生室，旨在加強農村醫療保健工作。
7、民國80年12月，成立群體醫療執業中心，以強化衛生所公共衛生服務。
8、民國83年3月1日，由前所長林筱璞醫師開辦全民健康保險門診醫療。
9、民國99年12月25日，因原臺南縣市合併升格為直轄市，改制為臺南市白河區衛生所，屬臺南市政府二級機關，隸屬臺南市政府衛生局。